Antecedentes: Diferentes investigaciones establecieron que el efecto matriz en el analisis de residuos de plaguicidas afecta la sensibilidad, precision y exactitud de las metodologias; la presencia de este fenomeno se atribuye a la adsorcion y/o descomposicion termica de los analitos en el puerto de inyeccion del cromatografo de gases. Objetivos: En el presente trabajo se evaluo la influencia de varios modos de operacion del inyector de temperatura programada, con el objetivo de reducir el efecto matriz en la determinacion de residuos de plaguicidas en alimentos. Metodos: El analisis se llevo a cabo en extractos de papa ( Solanum tuberosum ) mediante cromatografia de gases acoplada a espectrometria de masas. En este estudio se evaluo los modos de operacion del inyector de temperatura programada sin division de la muestra, los cuales corresponden a: en caliente, con pulso de presion y en frio. Finalmente, tambien se evaluo el modo de venteo de solvente y el efecto del volumen de inyeccion sobre la variacion de la respuesta cromatografica (efecto matriz). Resultados: Los resultados mostraron que el modo sin division en caliente ocasiona que la mayoria de los compuestos presenten efecto matriz, mientras que al emplear un pulso de presion se encontro una reduccion cercana al 20% de los compuestos que tienen efecto matriz. Por su parte, el sistema sin division en frio mostro el menor numero de compuestos con efecto matriz. Conclusiones: Los resultados indicaron que los modos de inyeccion en caliente sin division y con pulso de presion ocasionaron la mayor presencia de efecto matriz en mas del 70% de los compuestos estudiados. Por otro lado, el sistema sin division en frio mostro la mayor reduccion de la presencia de efecto matriz, respecto a cualquiera de los sistemas sin division en caliente. Adicionalmente, los resultados mostraron que existe una relacion inversa del efecto matriz con el volumen de inyeccion. Palabras clave: Plaguicidas, cromatografia de gases, alimentos, espectrometria de masas, residuos.