Colombia y en particular el Caribe colombiano ocupa una posicion privilegiada en el norte de Sudamerica debido a esto exhibe una gran variedad de ecosistemas que han permitido el asentamiento de diversos grupos humanos y diferentes costumbres. Estudios arqueologicos han permitido ubicar la existencia de humanos en la region Caribe desde hace mas de cuatro mil anos, mucho antes de la llegada de los espanoles. Estudios de la diversidad genetica en humanos en la region Caribe utilizando retrotransposones L1 son bastante escasos. En esta investigacion se analizaron 18 poblaciones de la region Caribe para determinar los niveles de diversidad y estructura genetica de las mismas utilizando los marcadores retrotransposones L1 por ser excelentes marcadores que reconstruyen relaciones filogeneticas entre poblaciones humanas. Para la extraccion de DNA se empleo la tecnica descrita por Sambrook et al., (1989) Para la PCR se realizo con volumenes de 25 μl. Luego los productos PCR se separaron utilizando electroforesis en gel de agarosa al 0.8%. Los resultados se analizaron de dos formas: a nivel global y a nivel poblacional.. Se midio la diversidad genetica de Nei (73) y el equilibrio Hardy-Weinberg. Los resultados mas relevantes obtenidos fueron: poca diferenciacion genetica y ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg a nivel inter e intra poblacional.