La substraccion digital es una tecnica utilizada en estudios radiograficos de lesiones periapicales y otras lesiones dentales, en las cuales el tratamiento debe ser evaluado a traves del tiempo. En este articulo se presenta un metodo automatico, rapido y confiable, para el registro y substraccion de radiografias digitalizadas con notorias diferencias de alineacion. La estrategia de optimizacion que permite encontrar la transformacion que registran las radiografias de forma optima se basa en un algoritmo genetico adaptativo (AG), que utiliza como medida de similitud la tasa de correlacion estadistica. El AG paralelo implementado aprovecha los ciclos libres de procesador de una malla de computadores personales estandar, dando como resultado un tiempo de ejecucion cercano a los veinte segundos para el registro de radiografias intraorales estandar. Al utilizar una infraestructura de computo existente y software de libre distribucion, el enfoque propuesto puede ser utilizado en hospitales publicos y otras instituciones de bajo presupuesto. La validacion adelantada muestra que no se presentan diferencias significativas entre el sistema automatico y el registro realizado de forma manual. Los resultados tambien evidencian que la tecnica de substraccion radiografica digital es una herramienta determinante en la valoracion de la mineralizacion osea posquirurgica en cirugia endodontica, en ambientes clinicos donde no es viable seguir un protocolo de estandarizacion.