Con el proposito de responder el interrogante por los cambios en el comportamiento innovador de las empresas del sector industrial, el articulo presenta y analiza los resultados que en materia de innovacion muestran las empresas manufactureras en la Primera encuesta de desarrollo tecnologico en el establecimiento industrial colombiano (EDT1), realizada en 1996, y la EDT2, consignados en la prueba piloto aplicada en el 2003 a 101 empresas. Para ello se integra la teoria evolutiva del cambio tecnologico con el enfoque de los recursos y las capacidades. Los resultados de la comparacion de los indicadores de las empresas innovadoras en las dos encuestas sugieren que, en un contexto estructural signado por precarios esfuerzos publicos y empresariales en el ambito de la ciencia y la tecnologia, entre 1996 y 2003 se presenta un avance sustancial en los esfuerzos y resultados de innovacion, asi como en la relacion de las firmas industriales innovadoras con el sistema nacional de innovacion. El articulo plantea, finalmente, hipotesis y lineas de trabajo para profundizar en el conocimiento sobre la innovacion en Colombia.