En el presente estudio, se realizan medidas de la actividad metabolica del sustrato sedimentos (SED) en un gradiente altitudinal de un rio tropical de montana (Sierra Nevada de Santa Marta-Colombia) con el fin de establecer su relacion con variables fisico-quimicas, hidrologicas e hidroclimaticas a lo largo de la cuenca durante eventos de sequia. Adicionalmente, se realizo un acercamiento al comportamiento de esta actividad durante un ciclo diario de luz y la variacion de la relacion ProduccionRespiracion (P/R) a lo largo del dia. Las mediciones se realizaron mediante el metodo de botellas claras y oscuras utilizando como sustrato extracciones de SED, con un tiempo de exposicion de dos horas. Para la estimacion del area real, se procedio a la obtencion de imagenes digitales de alicuotas de SED previamente pesadas, que fueron procesadas en el programa computacional ImageJ 1.40g. En el gradiente altitudinal se encontro que la respiracion de la comunidad (RC) fue mayor que la PPB haciendo que la relacion Produccion Primaria Bruta/Respiracion (P/R) sea <1. De acuerdo con los resultados obtenidos, la luminosidad es la variable que reviste mayor importancia, ya que esta se asocio con la relacion P/R en el tramo alto, y estuvo asociada con la PPB desde la cabecera hasta la parte baja del rio. De acuerdo con los resultados se sugiere que para el rio Gaira el sustrato SED es fuertemente heterotrofico (P/R <1) a traves del gradiente altitudinal, principalmente en el tramo medio de esta cuenca