Resumen Objetivos: Desarrollar una herramienta computacional en ambiente lenguaje de programacion hoc de NEURON y de facil uso, que permita el rapido almacenamiento de los resultados obtenidos para su posterior analisis en otros software tales como Matlab or IgorPro. Materiales y metodos: Para el desarrollo de Data Exporter se escribio un algoritmo en lenguaje de programacion hoc de NEURON. El algoritmo, escrito en un unico archivo de texto, esta dividido en 13 bloques, de los cuales solo el primero debe ser modificado para adaptarlo a una geometria y biofisica neuronal particular y para determinar la ruta de almacenamiento de los datos. Resultados: Se desarrollo un software que simula la propagacion de potenciales de accion a traves de geometrias neuronales complejas. El uso de esta herramienta permite el almacenamiento de los resultados obtenidos, como potenciales y corrientes de membrana en diferentes puntos de toda la neurona, sin incremento significativo en el tiempo para el desarrollo de los procesos. Conclusiones: Data Exporter es un software que le da mayor flexibilidad a NEURON facilitando el acceso a nuevos neurocientificos, los cuales pueden usarlo con solo conocer los codigos necesarios para el desarrollo de los archivos relacionados con las propiedades geometricas y biofisicas neuronales. Abstract Objectives: To develop a computational simulation tool in NEURON’s programming language hoc to be easily usable, in order to save the results generated by the software and later be analyzed with other tools such as Matlab and IgorPRo. Materials and Methods: To develop Data Exporter an algorithm was implemented in the programming language hoc used in NEURON. This algorithm was written in a text file and divided in 13 segments or program blocks, in which only the first one can be modified in order to be adapted to a particular geometry and neural biophysics and to determine the necessary path for saving the data. Results: Software that simulates the propagation of potential actions by using neuronal complex geometries was developed. The use of this tool allows the storage of the obtained results, as potential and membrane currents in different points of the whole neuron, without significant increase in the time for the development of the processes. Conclusions: Data Exporter is software that offers greater flexibility to NEURON and facilitates access to new neuroscientists who can use it by only knowing the codes related to geometry and biophysical properties of the neuron.
Tópico:
EEG and Brain-Computer Interfaces
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FuenteDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals)