Se compararon las eficiencias de tres metodos de electroforesis en agarosa y poliacrilamida, usando la camara pequena de DNA Sequencing System y camara grande OWL Sequi-Gen Sequencing Cell, en la deteccion del polimorfismo en 21 accesiones de naranja (Citrus sinensis) con empleo del cebador CGA. El gel de poliacrilamida dio mejor resolucion de los productos amplificados via PCR producidos por RAMs. Este permitio una mejor deteccion de bandas de ADN polimorficas, lo que facilito la identificacion de la variabilidad genetica. La electroforesis en agarosa puede ser mas conveniente en otras aplicaciones, debido al bajo costo y facil aplicacion. El estudio de diversidad genetica en naranja usando microsatelites RAMs diferencio 51 accesiones en siete grupos con 0.75 de similaridad y 0.25 de heterocigosidad, lo que revela bajo polimorfismo genetico. La tecnica RAMs permitio agrupar las accesiones en Comunes o Blancas, Navel y Pigmentadas o Sanguinas.