No se habia consolidado aun el poderio hispano en el Peru, cuando surgio la primera universidad: San Marcos, creada por Real Cedula de 12 de mayo de 1551, a dieciseis anos de la fundacion de Lima. Llamada San Marcos desde 1574, es un caso singular en la historia de la educacion; en Lima de entonces y demas ciudades peruanas existian solo algunas escuelas elementales. Asi, de un nivel de primeras letras se dio un salto a la educacion superior. La educacion intermedia surgio despues. En 1571 fue confirmada por Breve del Papa Pio V. San Marcos aparece como una Universidad estatal y pontificia, bajo el amparo de ambos poderes. Siguio el escolasticismo, en ella impero la ensenanza libresca, memorista y dogmatica. Fue aristocratica y elitista. La Universidad de San Cristobal de Huamanga (Ayacucho) fue fundada por el obispo del lugar en 1677, ratificada por real Cedula de 1680 y Breve Papal de 1682. La Universidad de San Antonio Abad, en Cusco, nacio con Breve Papal y Real Cedula de 1692. La Universidad de San Ignacio, tambien en Cusco (1621) se extinguio al ser expulsados los jesuitas (1767). Las caracteristicas de estas instituciones fueron semejantes a las de San Marcos. Todas reprodujeron el modelo universitario hispano. Y nacieron vinculadas a comunidades religiosas. La Universidad Nacional de Trujillo, primera de la republica, fue fundada en plena campana final de la emancipacion, el ano 1824, por Simon Bolivar y Jose Faustino Sanchez Carrion. Con ella comienza el modelo universitario republicano. Le siguio la Universidad Nacional San Agustin de Arequipa (1827); despues aparecio la San Carlos de Puno, de vida corta. La Universidad Catolica, la primera de caracter privado, fue creada en 1917