Se evaluo la abundancia de actinomicetes y hongos Micorriza Arbuscular (MA) en suelos bajo coberturas de bosque y pasto, en una zona de colonizacion de la Amazonia colombiana con tres grados de transformacion antropica. Se realizo una estratificacion espacial de la fragmentacion del paisaje de tierra firme, en cercanias de San Jose del Guaviare (Guaviare); a partir de informacion de una imagen de 1997 del satelite Spot y del uso de un sistema de informacion geografica (SIG), se obtuvo un mapa de coberturas vegetales y se selecciono la ventana de estudio de 48.000 ha. La abundancia de actinomicetes se determino por la metodologia de recuento y dilucion en placa; el porcentaje de MA, por clareo con KOH y tincion con azul tripano y la extraccion de esporas, por la tecnica de tamizado (Sieverding, 1983). Los suelos de fragmentos ubicados en la zona de intervencion antropica alta presentaron diferencias significativas entre coberturas, registrando valores menores de abundancia de actinomicetes y MA en pastos, lo que se explica por la alta compactacion de los suelos. En los fragmentos en la zona de intervencion menor no se encontraron diferencias significativas. Se identificaron nueve morfotipos para actinomicetes y diez para MA, siendo los mas representativos Streptomyces sp. y Glomus sp . Los suelos no presentaron diferencias significativas en sus caracteristicas fisicoquimicas. Se infirio que en zonas de intervencion alta estos grupos pueden ser posibles indicadores de procesos de alteracion del paisaje.