El cultivo de papa (Solanum tuberosum L.) se ve afectado por diferentes virus que reducen su rendimiento y la calidad del tuberculo-semilla. Determinar la distribucion y la variabilidad genetica de dichos patogenos, es fundamental para los programas de manejo integrado y mejoramiento genetico. En este trabajo se evaluo la presencia y la variabilidad molecular de aislados de PVX en cultivos de papa de los departamentos de Antioquia, Cundinamarca, Boyaca y Narino (Colombia). La evaluacion de presencia se realizo mediante pruebas de ELISA, mientras que el analisis de variabilidad incluyo la secuenciacion de una region parcial de la capsida viral en 14 aislamientos y de porciones de los genes codificantes para las proteinas RdRp y Tgb1 para dos aislamientos. Los resultados indicaron la presencia del PVX en los cuatro departamentos con un indice de deteccion promedio del 8%, siendo Narino la region con mayores niveles de deteccion (15%). Los analisis moleculares indicaron que la mayoria de aislamientos Colombianos se asociaron con cepas de Eurasia (Grupo I), mientras que dos aislamientos de Narino lo hicieron con el grupo de cepas Andinas y del Reino Unido (Grupo II). La informacion generada en este trabajo permitira apoyar los programas de certificacion de semilla y mejoramiento genetico de papa en Colombia.