Con el desarrollo de proyectos de investigacion sobre la biodiversidad regional en el departamento del Tolima (Colombia) durante los anos 2007 y 2008, en las cuencas de los rios Totare y Lagunillas respectivamente, se logro evaluar la riqueza biologica de 16 localidades en diferentes zonas de vida. Para la captura de murcielagos se utilizaron redes de niebla en los diferentes ecosistemas encontrados, las cuales estuvieron activas entre las 18:00h y 24:00h. Se registraron 41 especies para la cuenca del rio Totare y 16 para la cuenca del rio Lagunilla, de las cuales cuatro son nuevos registros para el departamento; Ryinchonycteris naso (Wied-Neuwied, 1820) (Emballonuridae), Vampyrum spectrum (Linnaeus, 1758) (Phyllostomidae), Molossusater (Molossidae) y la familia Noctilionidae con la especie Noctilio albiventris (Desmarest, 1818). Estos registros son de gran importancia en terminos de diversidad de quiropteros para el departamento puesto que indican que los recursos alimentarios y de refugio proporcionados por los bosques tolimenses parecen ser favorables para el establecimiento de una gran variedad de especies de murcielagos. Con estos resultados se puede indicar que la composicion de quiropteros ha aumentado a 62 las especies y a seis las familias reportadas para el Tolima. Los ejemplares fueron depositados en la Coleccion Zoologica de la Universidad del Tolima (CZ-UT).