La identificacion de especies de insectos, constituye uno de los aspectos mas importantes de la entomologia forense, la cual se ocupa de la correcta utilizacion de estos animales como testigos pasivos y elementos materia de prueba en asuntos legales, contribuyendo a la determinacion del tiempo (intervalo post mortem, PMI), causa, y lugar de la muerte. Sin embargo, la identificacion tradicional basada en el reconocimiento de caracteristicas morfologicas, no resulta completamente efectiva en algunas zonas en las cuales no se ha llevado a cabo la identificacion de caracteres particulares de las poblaciones alli presentes; asi como en aquellos casos en los que solo se dispone de individuos en estadios inmaduros, para los cuales estos no son lo suficientemente discriminatorios para determinar la especie o cuando la integridad de los individuos recolectados se encuentra comprometida y resulta imposible identificara dichas caracteristicas. Esto hace necesario el cultivo de los individuos hallados, aumentando el tiempo de respuesta del informe pericial e incluyendo variables de error al analisis del PMI. Con el fin de superar estas limitaciones, el presente estudio se ocupo de la generacion e implementacion de metodos eficientes de extraccion, amplificacion y analisis de las secuencias de dos fragmentos (de 819 y 637 pb) de ADN mitocondrial que incluyen los genes COI, COII y tRNALEU, a partir de una muestra preliminar de individuos necrofagos, en diferentes estadios del desarrollo, recolectados en diferentes localidades de la ciudad de Bogota. De esta forma, se logro identificar de forma eficiente, en un tiempo minimo de 72 horas, individuos pertenecientes a la familia Calliphoridae, la cual presenta un gran interes forense, ya que se encuentra ampliamente distribuida en nuestro pais y muy frecuentemente asociada a escenas de crimen. Los analisis de las secuencias revelaron un alto potencial para la identificacion de especies pertenecientes a esta familia, ya que mostraron valores de identidad maxima promedio superiores al 98%, asi como un alto nivel de variabilidad interespecifica con 35 y 33 sitios polimorficos informativos en los fragmentos COI y COII respectivamente. Finalmente, a partir de las secuencias obtenidas se confirmaron las relaciones evolutivas esperadas entre las especies identificadas, mostrando una buena senal filogenetica para las mismas