Objetivo La sifilis es una enfermedad infectocontagiosa, sistemica, de transmision sexual causada por la espiroqueta Treponema pallidum. Las intervenciones que disminuyan la incidencia de la sifilis congenita contribuyen con dos de las metas de desarrollo del milenio (MDG). Existen metodos de diagnostico y tratamiento para manejar la sifilis congenita, aunque, existen variaciones en seroprevalencia y el numero de casos anuales mundialmente, la situacion sigue siendo preocupante. El objetivo del estudio fue describir las disparidades por Departamentos en la incidencia de Sifilis congenita, en Colombia durante el periodo 2005 a 2011. Metodologia Se tomaron los registros del sistema de vigilancia del Instituto Nacional de Salud (INS), y de nacidos vivos (NV) y necesidades basicas insatisfechas del Departamento Administrativo Nacional de Estadistica-DANE de los anos 2005 a 2011. Resultados En Colombia la Incidencia global aumento de 2,15 casos por 1 000 NV en el ano 2005, (1 550 casos), hasta 3,28 Casos por 1 000 NV 2011 (2 078 casos), alejandose cada vez mas de la MDG (0,5 por 1 000 NV). Conclusiones El numero creciente de casos de Sifilis Congenita indica que sigue siendo un problema prioritario de salud publica, que el Sistema General de Seguridad Social en Salud no ha sido capaz de resolver, a pesar del aumento de cobertura y recursos que este ha tenido en los ultimos anos, lo que exige una re-evaluacion del impacto real que el Sistema ha tenido sobre los resultados en salud.