En la presente investigacion se estudian las caracteristicas citogeneticas de cinco ecotipos de Physalis peruviana, tres silvestres distribuidos en Boyaca y Cundinamarca y dos ecotipos cultivados, uno nativo el ecotipo “Colombia” distribuido en Cundinamarca y un ecotipo foraneo, procedente de Kenia, que se cultiva actualmente en nuestro pais en el municipio de Paipa (Cundinamarca). Los resultados citogeneticos se obtienen luego de la estandarizacion del protocolo de obtencion de apices radicales a partir de semillas y hojas, empleando medios de cultivo in vitro. Se estandarizo el protocolo de obtencion de cromosomas, empleando diferentes tecnicas de pretratamiento, fijacion, hidrolisis y montaje de las muestras, adicionalmente se evaluo la duracion del ciclo celular para establecer la hora mitotica. Los resultados de la aplicacion de estas tecnicas, muestran una amplia variabilidad en la dotacion cromosomica de las poblaciones estudiadas. Adicionalmente se evaluaron caracteristicas morfologicas y anatomicas (Altura de las plantas, area foliar, numero de estomas/mm2, numero de cloroplastos en las celulas guarda de los estomas, diametro de los frutos y semillas y contenido de masa seca) para confrontarlas con los datos citogeneticos. Se evaluo la accion de la colchicina, para inducir la poliploidizacion en esta especie, para ello se eligieron frutos del ecotipo “Colombia” con un alto contenido de azucares y sus semillas se cultivaron in vitro con el inhibidor mitotico, obteniendose un diploide directo de este ecotipo. Se recomendo hacer un seguimiento de este material, para evaluar esta tecnica dentro del programa de fitomejoramiento.