El presente articulo examina cuales son los factores institucionales que tienen relacion con el rendimiento academico en matematicas. Para ello se tomo un corte transversal de 1653 estudiantes que presentaron el examen de Estado de la educacion media (Saber 11) en el 2010, provenientes de 44 instituciones educativas de la ciudad de Medellin - Colombia. La estimacion se hizo por medio de un Modelo Lineal Jerarquico cuyas variables independientes se clasificaron en dos niveles: estudiante e institucion. Los principales resultados evidencian que el 31,4% del rendimiento de los estudiantes en matematicas es explicado por variables institucionales como el numero de horas de matematicas, el pertenecer a colegios privados y de un solo genero, el uso de texto guia y el tamano del colegio.