Los filtros biologicos viabilizan el reuso de aguas residuales (AR) en sistemas de recirculacion acuicola (SRA), su desempeno depende entre otros factores, del tipo de filtro, medio soporte e inoculo utilizado. Se evaluaron las eficiencias de diferentes inoculos para el tratamiento de AR provenientes del cultivo de trucha arcoiris mediante biofiltros de flujo ascendente en un SRA. Se utilizo un tanque para cultivo con control de nivel, un filtro con bolsas de lienzo para retencion de solidos y seis biofiltros de diametro 3” con arena como medio soporte y tiempo de retencion hidraulica (TRH) de 11 min. Los inoculos utilizados fueron: R1-control: aguas del SRA; R2-lodos estacion piscicola; R3-agua laguna aereada relleno sanitario Antanas (RSA); R4-sedimentos de acuarios; R5-lodos laguna aereada RSA; R6-lodos reactor sulfidogenico RSA. No hubo diferencias estadisticamente significativas entre los reactores para remocion de DQO, fosforo, amoniaco y nitritos, cuyas remociones medias fueron de 45,3; 15,1; 4,7 y 27,2% respectivamente. Hubo diferencias estadisticas entre reactores para remocion de color y nitratos, las mejores eficiencias fueron para: color R6:38,8% y R1:37,3%; para nitratos R5:47,3% y R6:42,8%; demostrandose la influencia de consorcios microbianos en los SRA.