Se estudio el nivel de variabilidad genetica de una poblacion de 35 aislamientos de Phytophthora infestans obtenidos en diferentes hospedantes y regiones geograficas de Colombia, mediante las tecnicas de haplotipos mitocondriales y RAPD. Los resultados encontrados sugieren la existencia en el pais de los haplotipos mitocondriales Ia en los aislamientos que afectan tomate de arbol (Solanum betaceum) y IIa en cultivos de papa; dichos haplotipos estan asociados a los linajes geneticos EC-3 y EC-1, respectivamente. Sin embargo, tres aislamientos obtenidos en tomate de mesa (S. lycopersicum), pimenton (Capsicum sp.) y pepino de agua (S. muricatum) requieren de un analisis posterior, debido a la falta de correlacion entre los perfiles de restriccion generados con los cuatro pares de cebadores utilizados en esta prueba y los haplotipos mitocondriales mencionados en la literatura. De otra parte, mediante cuatro cebadores RAPD, fue posible encontrar variabilidad al interior de los dos linajes geneticos, siendo interesante el hecho que los aislamientos obtenidos en tomate de arbol (EC-•3) fueron divididos en dos grupos, relacionados con una distancia genetica de 0,17. Estos hallazgos indican que es importante contemplar las fuentes de variacion asexual en el analisis de la estructura poblacional de este oomycete y por tanto en el diseno de las estrategias de control de las enfermedades que causa P. infestans en cultivos de solanaceas de importancia economica.