Debido a la poca informacion ecologica, taxonomica o genetica sobre las ardillas colombianas, existen problemas sistematicos aun no resueltos (Emmons LH, 1990), lo cual dificulta la reubicacion y/o liberacion de ejemplares sin procedencia, provenientes del trafico ilegal de fauna silvestre. Estudios cariologicos sirven para detectar variaciones intra e interespecificas por lo que en este trabajo se busco detectar diferencias cariotipicas entre varios fenotipos Sciurus granatensis. La diferenciacion genetica en conservacion, puede ser una herramienta util en la toma de decisiones en los procesos de liberacion de ejemplares capturados, dado que la introduccion de individuos con genomas diferentes en un poblacion puede originar un proceso de depresion por exogamia o introgresion genetica (perdida de alelos adaptativos locales), procesos nocivos para la poblacion receptora. Se estudiaron siete especimenes (cinco hembras y dos machos) de S. granatensis procedentes del trafico ilegal. Los cariotipos fueron obtenidos a partir de cultivos de linfocitos de sangre periferica. Las metafases con bandas G, R, C, Q y NOR, se analizaron al microscopio y se ordenaron en el programa Lucia Karyotyping®. Los individuos estudiados corresponden a los tres fenotipos reportados por Emmons LH, 1990, pero con una gran variacion cariologica. Solo uno de los machos no corresponde a los fenotipos descritos, y ademas presenta varios rearreglos cromosomicos que lo diferencian notablemente de los demas, por lo cual posiblemente se trate de un hibrido esteril originado de dos poblaciones diferenciadas cariologicamente. El numero de cromosomas fue constante (2n=42), con variacion en el numero fundamental (NF=80; 81), por lo cual se reportan tres cariomorfos para Sciurus granatensis, segun NF y los rearreglos cromosomicos encontrados. Se observo variacion en los pares 9, 16 y una translocacion universal entre autosomas dentro de uno de los ejemplares. El cromosoma X es submetacentrico mediano. El cromosoma Y es acrocentrico, coincidente con lo descrito para Sciurus. No se registro una relacion cariotipo-fenotipo. Por lo tanto se puede sugerir que Sciurus granatensis, es un complejo de especies con diferencias cariologicas y morfologicas que no ha sido estudiado a profundidad teniendo en cuenta su amplia distribucion geografica.