Son derivados del acido prostanoico, el cual es un acido graso con un anillo citlopentanico entre los carbones 8 y 12. Se han encontrado en casi todos los tejidos de los mamiferos y la mayoria de ellos tienen el poder de sintetizarlos. En el organismo animal se forman de acidos no saturados de 20 carbones mediante el complejo enzimatico prostaglandina- sintetasa localizado en los microsomas celulares. Todas las prostaglandinas naturales tienen un grupo hidroxilo en el Cl5 y un doble enlace entre Cl3 y Cl4. La prostaglandina (PG F2CJ) tiene ademas un doble enlace entre C5 y C6, y un alfa hidroxilo en Cg y c11, de manera que el subindice 2 se refiere a los dos dobles enlaces (insaturacion y alfa (α) a la configuracion del hidroxilo en c9. En la naturaleza la PG F2 a se forma mediante la accion de la prostaglandina sintetasa sobre el acido araquidomico y se metaboliza finalmente mediante la accion de una hidrogenasa primero y luego de una reductasa, como 13, 14, dihidro 15 ceto PGF2 a, que es excretada por el rinon.