Con el proposito de evaluar la participacion de las bacterias heterotroficas en el flujo de carbono en la cadena trofica de un lago de inundacion amazonico, colectas mensuales de estos microorganismos fueron realizadas durante el ano hidrologico de diciembre de 2007 hasta noviembre de 2008, en las regiones litoral, pelagica y de macrofitas acuaticas del lago Catalao, en la Amazonia Central brasilera. Las bacterias fueron multiplicadas in vitro, usando como sustrato el carbono organico disuelto (COD) del lago en cada una de las regiones estudiadas, para posterior analisis de la abundancia de isotopos estables de carbono y nitrogeno. Estos datos fueron confrontados con los valores de COD de los cuatro periodos limnologicos del lago (seca, inundacion, llena y bajada de aguas). En general se encontro que la fuente principal de carbono de las bacterias heterotroficas fue aquella de origen C4, que presento un aporte minimo de 75%, en la medida en que el δ13C de las bacterias presento valor medio de -17,72‰ ± 2,25. Confrontando ese valor, con el δ13C del zooplancton en el mismo periodo (-33,04‰±3,81) se concluye que el aporte de las bacterias heterotroficas al flujo de carbono hacia niveles troficos superiores en el lago estudiado es minimo.