Las enfermedades autoinmunes comprenden un conjunto de desordenes cronicos multisistemicos y complejos de etiologia desconocida, asociados a factores geneticos, hormonales y ambientales. La susceptibilidad a padecerlas incluye la presencia de ciertos genes, algunos de ellos del complejo mayor de histocompatibilidad (CMH), combinados con determinados autoanticuerpos. Clinicamente definida, la enfermedad autoinmune es precedida por un largo periodo de tiempo en el que ciertos tipos de autoanticuerpos se pueden identificar en el suero. En conjunto, los autoanticuerpos y la identificacion de alelos de susceptibilidad se pueden usar como predictores del inicio de la enfermedad e, inclusive, de ciertas manifestaciones clinicas y desenlaces. A continuacion revisamos los principales factores de riesgo usados como predictores de enfermedades autoinmunes, al igual que las potenciales implicaciones clinicas y eticas.