El gusano de seda Bombyx mori se caracteriza por presentar una amplia variabilidad en los caracteres de productividad y desarrollo los cuales presentan herencia poligenica. Muchos caracteres morfo-bioquimicos de gusano del seda se han asociado con marcadores moleculares como los RFLPs y los RAPDs mapeandose en diferentes grupos de ligamiento. Sin embargo, se ha prestado poca atencion a la definicion de su verdadera funcion dentro del organismo completo. Para llevar a cabo una aproximacion preliminar a este problema, se evaluaron cinco combinaciones de iniciadores AFLPs con un total de 302 bandas sobre el ADN genomico de 16 lineas de gusano de seda de origen japones y chino. Dichas lineas presentaban diferentes caracteristicas de productividad como peso de capullo y de corteza lo que permitio su discriminacion en grupos definidos de alta y baja productividad. Los datos de productividad y la informacion de los marcadores moleculares para cada una de las lineas fueron correlacionados mediante analisis de varianza multiple. Estos analisis se realizaron con los marcadores agrupados de acuerdo con las combinaciones de iniciadores utilizados. La significancia se fijo en el 95%. Se eliminaron los marcadores que tenian una presencia o ausencia menor al 5%. Para los restantes se asigno una cota de la varianza en base a la cual se determino la significancia del marcador. Se identificaron marcadores asociados estadisticamente con peso de capullo y de corteza separadamente, al igual que algunos marcadores asociados con ambos caracteres de productividad.