Se aislaron 18 cepas nativas de Bacillus sphaericus patogenas a larvas de mosquitos de diferentes regiones de Colombia. El objetivo de este estudio fue evaluar a nivel fisiol6gico y molecular cepas patogenas y compararlas con la de referencia 2362. Se evaluo el crecimiento celular, el porcentaje de esporulacion, la patogenicidad en larvas de tercer instar de Culex ouinquejasciatus, la presencia de las proteinas toxigenicas, el tamano de plasmidos nativos y el polimorfismo genetico entre aislamientos patogenos y no patogenos. Las cepas de Bs evaluadas presentaron una etapa de latencia de 2-3 h y una fase logaritmica de 7 h; la esporulacion en BHI fue menor del 1% a las 40 h de incubacion; en el medio NYSM se obtuvo diez veces mas produccion de biomasa y de esporas; e126% de la poblacion mostro porcentajes de esporulacion superiores al 90%; los aislamientos clasificaron en tres grupos de patogenicidad con [Formula] y [Formula] Se detectaron mutaciones puntuales en los genes que codifican para las toxinas nativas, y se ha1l6 una proteina de 30 kDa exclusiva de las cepas nativas patogenicas. Los aislamientos de Bs presentaron un plasmido de 118 Kb, no relacionado con la toxicidad; las cepas patogenas son un grupo homogeneo con una similitud entre el 90-100%, mientras que las no pat6genas son geneticamente heterogeneas y conforman un cluster aparte. Las cepas nativas tienen un gran potencial en control biologico de larvas de mosquitos transmisores de enfermedades, tales como dengue, malaria, encefalitis y filariasis, entre otras.