El Rio Pasto es una fuente hidrica muy importante porque atraviesa toda la ciudad de su mismo nombre, convirtiendolo en el receptor de todos los vertimientos de aguas residuales e industriales que se genera en la ciudad. Actualmente se esta haciendo diferentes estu-dios para evaluar su estado y determinar el grado de los impactos generados.Generalmente la evaluacion de la calidad del agua se hace por medio de parametros fisico – quimicos, los cuales suministran informacion instantanea de las con-diciones del agua. Un metodo alternativo para evaluar la calidad del agua, con un alto nivel de confiabilidad y que muestra las condiciones presentes y pasadas de un cuerpo de agua es la utilizacion de bioindicadores. En los ecosistemas loticos, los principales grupos de orga-nismos que se utiliza como indicadores, son las algas de perifiton y los macroinvertebrados acuaticos.En el caso especifico de este estudio se va a determinar la calidad del agua del Rio Pasto mediante la utilizacion de los indices de Margalef y Simpson para algas de pe-rifiton y el metodo BMWP/Col para macroinvertebra-dos acuaticos.