RESUMEN Los microsatelites o STR por su sigla en ingles (Short Tandem Repeat) son repeticiones de secuencias cortas de nucleotidos a traves del DNA, de gran importancia debido a su caracter polimorfico que permite su utilizacion en la identificacion genetica de individuos o poblacionales. En este trabajo se investigaron los perfiles geneticos de una muestra de poblaciones humanas del altiplano cundiboyacense en Colombia; se usaron los marcadores STR’s D2S1338, D19S433, PENTA D, PENTA E y SE-33. Estos cinco STR’s fueron amplificados mediante reaccion en cadena de la polimerasa (PCR), corridos con electroforesis capilar, y tipificados con los programas Genscan y Genotyper. Como resultado se reportan las frecuencias alelicas de los cinco microsatelites (no reportados anteriormente para esta region). Se encontro que los loci D19S433 y SE-33 no estan en equilibrio de Hardy-Weinberg; y que el Penta E tiene el mayor poder de discriminacion. La distribucion de las frecuencias alelicas para los cinco marcadores, en las dos poblaciones analizadas mostro que no existen diferencias estadisticas significativas entre ellas. Palabras clave: STR, D2S1338, D19S433, PENTA D, PENTA E, SE-33. ABSTRACT Microsatellites (STR’s) are short tandem repeat sequences of nucleotides through DNA, very important for their polymorphic character that allow their utilization in population genetic identification. The STR’s markers D2S1338, D19S433, PENTA D, PENTA E y SE- 33 were used to do the genetic profiles of human populations from the Cundiboyacense region in Colombia. The five STR’s were amplified by PCR (polymerase chain reaction), indentified with capillary electrophoresis, and typified with Genscan and Genotyper software. Allelic frequencies of the five microsatellites are reported (not previously reported for this region). It was found that loci D19S433 y SE-33 are not in Hardy- Weinberg equilibrium; and Penta E provides the greatest power of discrimination. The allelic frequencies distribution to these five markers, in the two populations studied show that it does not exist statistically significant differences between them. Key words: STR, D2S1338, D19S433, PENTA D, PENTA E, SE-33.