Se estudio la diversidad y diferenciacion genetica de 224 accesiones de yuca tradicionalmente cultivadas en Uganda. Adicionalmente, se incluyeron estudios previos de diversidad, 20 materiales de Tanzania, 20 de Ghana, 22 de Nigeria, 20 de Guatemala y 12 accesiones representando la coleccion nucleo de Latinoamerica, mantenidas en CIAT. Nueve grupos basados en el pais de origen fueron creados para estudiar la variacion genetica dentro y entre paises. Usando secuencias simples repetidas (SSR) o marcadores microsatelites, la variacion en las frecuencias alelicas en 35 loci no ligados sirvio para estimar los parametros de diversidad y diferenciacion genetica. Los resultados afirman una divergencia genetica entre accesiones africanas y latinoamericanas, y una fuerte diferenciacion de algunas accesiones de Guatemala con respecto a los otros paises. Ellos tambien muestran una alta diversidad genetica dentro de paises y una moderada diferenciacion entre ellos. En particular Uganda mantiene alta diversidad genetica dentro Distritos aun despues de una reciente epidemia de CMD (cassava mosaic disease) pero baja diferenciacion entre ellos. Se discuten las posibles fuerzas implicadas en la dinamica de la diversidad genetica, la importancia de Guatemala en los programas de mejoramiento de yuca en la busqueda de grupos con potencial heterotico, el bajo impacto causado por CMD en la constitucion genetica del cultivo en Uganda y la observacion de una distribucion continua de la diversidad genetica.