Giardia intestinalis es un parasito de amplia distribucion mundial, causante de enfermedad diarreica aguda no bacteriana. La transmision del parasito es fecal –oral y puede ocurrir entre humanos, humanos – animales y animales – animales, siendo el agua la principal fuente de contaminacion, por lo que en terminos generales se considera que esta parasitosis es un importante problema de salud. Este parasito protozoo presenta alta variabilidad genetica, lo que le confiere diversidad de hospederos. Se han identificado ocho genotipos del parasito relacionados con hospederos especificos; pero tambien son considerados algunos genotipos inespecificos, lo que favorece el ciclo zoonotico del parasito. Existen algunas tecnicas usadas de manera convencional para el diagnostico de la infeccion por G. intestinalis, sin embargo tienen poca sensibilidad debido a la eliminacion intermitente de los quistes del parasito; por lo que el desarrollo de las nuevas tecnicas moleculares, tales como Reaccion en Cadena de la Polimerasa (RCP), Polimorfismo en los fragmentos de restriccion (RFLP), Secuenciacion, abre nuevos horizontes para la investigacion en este campo. Se conoce poco respecto al papel de los animales domesticos, la distribucion de los genotipos circulantes en nuestro medio y el impacto sobre la salud. El objetivo de este trabajo es describir las caracteristicas particulares de G. intestinalis, el problema de salud que representa, las herramientas moleculares disponibles y su utilidad para responder preguntas no aclaradas sobre el ciclo de este importante protozoo.