Resumen: Las sociedades amerindias sufrieron un profundo deterioro de la salud durante el contacto Europeo y la posterior colonizacion de las Americas. Igualmente la diversidad en la dieta y la calidad nutricional decrecieron mientras que la violencia y las labores de trabajo se incrementaron considerablemente. Las consecuencias socioculturales de dicho contacto han sido suficientemente documentadas p or la arqueologia, la historia y la etnohistoria. Sin embargo las secuelas biologicas son menos claras. Este articulo evalua el impacto biologico de la llegada de los colonizadores Europeos al norte de Sur America a traves del estudio de los restos oseos de dos comunidades coloniales Nativas del Sur-occidente de Colombia. La primera proviene del yacimiento arqueologico“El Alto del Rey” (ca 1200-1600 d.C) en el Departamento del Cauca y la segunda. proviene del cementerio posthispanico de“Maridias” (1615-1720 a.C) en el Departamento de Narino. Se obtuvieron datos de diferentes tipos de enfermedades dentales, asi como de estres fisiologico y de radios de isotopos estables de carbono (12C y 13C) y nitrogeno (15N) para conocer mejor el tipo de alimentacion, la diversidad dietaria y nutricion y el estado de salud oral de las comunidades nativas colombianas bajo el dominio Espanol. Los analisis paleopatologico-dentales muestran un notable incremento en los indices de caries, calculo, enfermedad periodontal, perdida dental antemortem (PDA) e hipoplasias del esmalte. En concordancia el estudio isotopico revelo un abrupto incremento en el consumo de plantas ricas en carbohidratos y alta dependencia de plantas como el maiz y otros granos. Este analisis muestra que el impacto europeo fue mas notable en la poblacion de Maridias dado que estuvo expuesta a un periodo de contacto mas duradero y directo que el Alto del Rey. Al mismo tiempo esta investigacion sugiere un notorio y profundo cambio en la nutricion, salud y forma de vida de estas comunidades. Finalmente se subraya la importancia de los restos humanos esqueletizados como fuentes de datos para nuestro mejor entendimiento de las dinamicas del cambio biocultural resultante de la colonizacion en Colombia. Revista Estomatologia 2007; 15(2) Supl. 1:17-37. Palabras clave: Paleopatologia. Periodo poscontacto. Patologias dentales. Isotopos estables. Salud oral. Paleodieta. Sur Occidente Colombiano. Summary: Native American societies suffered a profund deterioration of health under European colonization. In addition, diet diversity and nutritional quality decreased whereas workloads and violence increased considerably. Social and cultural consequences of such contact have been well documented by archaeology, history and ethno-history. However, the true biological impact is poorly understood. This paper assess the biological impact of the European arrival to northern South America through the study of human skeletal remains of two native Colonial societies from the post-contact period in the Colombian South West. The first sample came from “El Alto del Rey” (ca 1200-1600 a.C), at Cauca Department, and the second from “Maridias” (1615-1720 a.C), types of dental diseases were obtained as well as physiological stress indicators and stable isotopes ratios of carbon (12C y 13C) and nitrogen (15N). These data were used to try to determine food intake, dietary diversity, nutrition, and the state of oral health of the Colombian native communities under Spanish control. Dental paleopathological analyses showed a high increase in the rates of caries, dental calculus, periodontal disease, antemortem tooth loose (AMTL) and enamel hypoplasias In agreement with these results, the isotope analysis reveals an abrupt increase in the plants rich in carbohydrates consumption and high dependency on plants such as corn and other grains. Changes were more considerable in Maridias than in El Alto del Rey, since the former was exposed to a longer and more direct colonial contact. In addition, this study suggests deep changes in diet, health and way of life of these communities. The bioarchaeological analysis of human skeletal remains represents an important source for a better understanding of the dynamics of the biocultural change resulting from colonization in Colombia. Key words: Paleopathology. Post-contact period. Dental diseases. Stable isotopes. Paleodiet. Oral health. Colombian Southwest.