En el presente texto se analiza la evolución de la política de gestión de áreas protegidas en Colombia que tuvo un cambio fundamental en la última década del siglo xx. Además, se estudian las normas que regulan el licenciamiento ambiental de proyectos dentro de las áreas protegidas y sus implicaciones en materia de competencias y límites y el proceso de Evaluación e Impacto Ambiental. Finalmente, se estudian los casos relacionados con licencias ambientales otorgadas dentro de algunas de las áreas protegidas más importantes del país y también del nivel regional.