En la zona litoral y pelágica de la ciénaga Cerro de San Antonio, entre el 22 y 23 de octubre de 2004 se realizaron perfiles verticales de temperatura, oxígeno disuelto, conductividad eléctrica y pH. Se colectaron muestras de agua para evaluar las principales características fisicoquímicas y biológicas. Se estableció la productividad primaria fitoplanctónica y se realizaron colectas para evaluar la composición y biomasa del fitoplancton. La laguna se clasifica como polimíctica cálida continua. Los valores de las variables fisicoquímicas fueron