ResumenObjetivo:determinar las características y los factores asociados a la malnutrición infantil en menores de 5 años en el municipio de Neiva, Colombia.Método:estudio transversal, a partir de datos secundarios reportados en el Sistema de Vigilancia Alimentario y Nutricional (SISVAN) de los niños y niñas de 0 a 59.99 meses con clasificación nutricional de desnutrición aguda, crónica, global, sobrepeso y obesidad en el municipio de Neiva. Se realizó caracterización estadística con datos del periodo 2018-2022 y sociodemográfica y geográfica con la información del año 2022. Para el análisis estadístico se usó Stata 15 aplicando medidas de tendencia central y asociación, y una regresión logística binaria para evaluar la relación entre las variables de estudio.Resultados:en el año 2022 fueron identificados 1 315 niños y niñas con malnutrición. La prevalencia de esta fue mayor para el déficit que en el exceso, en varones, con edades entre 23-59.9 meses, del área urbana y con régimen subsidiado. La malnutrición infantil se presentó principalmente en la zona periférica de la ciudad, en las comunas 6, 8, 9 y 10. Se encontró asociación estadística entre el exceso de peso con el régimen de afiliación con capacidad de pago (OR: 2.01; IC 95 %: 1.60–2.53; p < 0.001), la malnutrición por déficit con régimen subsidiado (OR: 1.99; IC 95 %: 1.59–2.51; p < 0.001), doble carga individual de malnutrición con menores de 2 años (OR: 5.51; IC 95 %: 1.92–21.70; p < 0.001) y residencia en el área rural (OR: 2.86; IC 95 %: 1.09–6.70; p: 0.0085).Conclusiones:en el municipio de Neiva coinciden los dos extremos de malnutrición infantil, por déficit y por exceso, asociados a factores socioeconómicos que impactan directamente en la posibilidad de adquisición y selección de alimentos saludables.