En este trabajo se evalúa la eficiencia de las políticas públicas del factor Ciencia, Tecnología e Innovación (CTI) de los departamentos Córdoba, Atlántico y de Bogotá Distrito Capital. Esto se hace, describiendo los principales componentes del factor CTI, diagnosticando la situación competitiva de los departamentos y del distrito, mediante el uso de diferentes indicadores para poder realizar un comparativo de la política departamental de CTI. A partir de los resultados estudiados, se observa que Bogotá es la ciudad más competitiva a nivel nacional y la líder en las áreas de CTI. Por el contrario, Córdoba se encuentra en un retraso considerable, incluso frente a Atlántico, por lo que se recomienda una mayor integración y participación de entes públicos y privados mediante la implementación de políticas que promuevan realmente el desarrollo científico, tecnológico e innovador. El fortalecimiento del vínculo Universidad-Empresa-Estado es la clave para el mejoramiento de los índices de competitividad del país en general y del departamento de Córdoba en particular.