Objetivo Identificar las barreras en la atención de la salud en pacientes con defectos congénitos (DC) visuales y auditivos atendidos mediante el Programa de Atención Integral a Familias con Enfermedades Huérfanas con Compromiso Visual y/o Auditivo (AIVA), en Bogotá D. C., Colombia. Materiales y Métodos Estudio transversal realizado en 58 niños con diagnóstico de DC con posible compromiso visual o auditivo. La población de estudio se seleccionó de la base de datos del programa AIVA, y para la obtención de los datos se les solicitó a los padres o representantes legales llevar a los niños a una valoración médica inicial y responder una entrevista. Las barreras se clasificaron según el modelo de cobertura efectiva de Tanahashi y los datos se analizaron mediante estadística descriptiva; se calcularon frecuencias absolutas y relativas para las variables cualitativas, y medias y desviaciones estándar o medianas y rangos intercuartílicos (según la distribuciún de los datos determinada con la prueba Shapiro-Wilk) para las cuantitativas. Resultados El 81,03% de los padres o representantes legales manifestaron al menos una barrera, siendo las más frecuentes las de disponibilidad (49,38%), seguidas de las de accesibilidad (32,24%), aceptabilidad (11,83%) y contacto (6,53%). Conclusión La mayoría de los padres o representantes legales entrevistados reportaron barreras de acceso a los servicios de salud. Dado que estas repercuten de forma negativa en la salud de los niños con DC, se requieren intervenciones conjuntas para reducirlas y así garantizar mejores condiciones de salud en los niños con DC y compromiso auditivo o visual.