El desarrollo del pensamiento crítico en los estudiantes desde los primeros años escolares, es uno de los principales pilares que conducen a los sujetos a proyectarse frente a una sociedad y un mundo en constante cambio; desde el Ministerio de Educación Nacional de Colombia, se busca fortalecer a los sujetos en habilidades de pensamiento que soporten tal fin. El objetivo del estudio se centró en el análisis de las percepciones y de las prácticas pedagógicas abordadas por los docentes desde el programa “Todos a aprender” en su componente pedagógico, identificando fortalezas y debilidades y cómo estas contribuyen al desarrollo del pensamiento crítico de los estudiantes. El estudio se desarrolló en la comuna 3 del municipio de Medellín en 5 instituciones educativas de carácter público, con docentes de básica primaria y con el tutor de cada institución en las cuales se lleva a cabo el programa. Metodología cualitativa y paradigma epistemológico interpretativo, aplicándose entrevistas semiestructuradas y análisis documental. Las categorías trabajadas: estrategias pedagógicas, prácticas pedagógicas y desarrollo de habilidades de pensamiento crítico. Se concluye que, en el desarrollo del pensamiento crítico y reflexivo de los estudiantes, es esencial que en las Instituciones Educativas generen espacios de reflexión y diálogo entre los docentes en pro del fortalecimiento de las prácticas pedagógicas; en los procesos de enseñanza y aprendizaje influyen por una parte, las prácticas pedagógicas de los docentes, el entorno familiar en donde el nivel socio-económico y la baja escolaridad de los padres se relaciona con desarrollo del pensamiento crítico de los estudiantes.