Las negociaciones de justicia y paz con los grupos de las autodefensas (AUC) se adelantaron durante el gobierno de Álvaro Uribe Vélez, exactamente en el periodo (2003-2006), y culminaron con la desmovilización de más de 30.000 hombres en todo el territorio nacional. El artículo pretende responder a la pregunta acerca de ¿cuál fue la dinámica del conflicto urbano que se vivió en Medellín durante el devenir del proceso de negociación con las autodefensas? Para responder a este interrogante, se recurrió a la observación documental, herramienta que permitió la indagación de fuentes hemerográficas, como el periódico El Colombiano, diario de circulación regional, en el que se pudo revisar las acciones violentas, reconocer los actores armados implicados, registrar las operaciones militares adelantadas por la fuerza pública y visibilizar las acciones violentas perpetradas contra líderes sociales durante el proceso de negociación de justicia y paz con las AUC. Asimismo, se revisó bibliografía especializada y documentos oficiales. Entre los hallazgos se encontró que hubo un incumplimiento del cese de hostilidades, desescalamiento relativo de las acciones violentas por parte de los grupos paramilitares, y un fortalecimiento de ese hilo invisible entre las bandas criminales y las AUC en Medellín.