Objetivo: Caracterización de las afectaciones económicas generadas por el COVID-19 a los prestadores del servicio de transporte especial (Turismo) del Caquetá 2020- 2021, además, se analizó el sistema de control interno y su importancia en este contexto. Método: se implementó las técnicas de investigación cuantitativa, ya que permiten un análisis de datos, tales como estadísticos y estados financieros en las cuatro (4) agencias de transporte especial en el Caquetá: Sanviestur y Constracaguan (San Vicente del Caguán), Amazonia (El Paujil) y Prointures S.A.S (Florencia). Resultados: la agencia más afectada fue la Amazonia ya que cerró definitivamente. Sanviestur, Constracaguan y Prointures tuvieron grandes pérdidas económicas durante la pandemia, pero lograron mantenerse hasta hoy en día. Discusión: los controles internos son una herramienta indispensable para asegurar el logro de los objetivos y la mejora continua de la entidad, cuya implementación redunda en resultados y en la concreción de las decisiones reflejadas en los planes de la organización. A partir de un modelo integrado de planificación y gestión, se brindan lineamientos y buenas prácticas para establecer controles y acciones, métodos y procedimientos de gestión de riesgos que permitan a las entidades evaluar y monitorear los procesos para verificar su cumplimiento, conformidad y contramedidas, tal afirmación se ve corroborada en la agencias de transporte especial Sanviestur, Constracaguan y Prointures ya que estas lograron sobrellevar todas las dificultades que llegaron junto con el Covid-19. Conclusiones: de acuerdo a los ingresos económicos de las agencias en los años anteriores, se presentó un cambio drástico en la temporada de la pandemia del Covid-19; su impacto fue significativo, ya que las restricciones a la movilidad y su nivel económico provocaron directamente una caída considerable de la demanda de servicios.