La presente investigación tuvo como propósito el fortalecimiento de las competencias procedimentales en las ciencias naturales en estudiantes de grado octavo de la Institución Educativa María Antonia Penagos de Palmira, Valle del Cauca. Para esto, se empleó una metodología cualitativa y descriptiva. La muestra fue no probabilística de 33 estudiantes. Durante el trabajo de investigación, se hizo un reconocimiento inicial mediante la aplicación de técnicas como la encuesta y la entrevista que permitieron hacer un diagnóstico preliminar y posteriormente diseñar la propuesta pedagógica estructurada en una secuencia didáctica que dentro de sus actividades contemplaba el uso de laboratorios virtuales en dos plataformas diferentes: CloudLabs (CloudLabs virtual stem: Entorno Virtual De Aprendizaje, 2023) y PhET interactive simulation (Simulaciones interactivas PhET, s. f.). Una vez aplicada la propuesta pedagógica, se evaluó su impacto mediante un cuestionario final y una entrevista a un grupo focal de estudiantes. Se evidenció que los estudiantes mostraron agrado y motivación durante la implementación de la propuesta pedagógica, esto se reflejó en la mejora de las competencias procedimentales, por consiguiente, se concluye que a través del uso de laboratorios virtuales como herramienta didáctica se pueden fortalecer las competencias procedimentales en ciencias naturales.