Introducción: el síndrome de intestino irritable (SII) es el principal trastorno funcional gastrointestinal caracterizado por múltiples síntomas sin una causa orgánica clara, constituye un problema de salud por sus altos costos e impacto en la calidad de vida.Objetivo: determinar la prevalencia del síndrome de intestino irritable en los estudiantes de Medicina de la Fundación Universitaria San Martín Sabaneta a noviembre de 2016.Materiales y métodos: estudio de corte transversal, incluyó los estudiantes de Medicina de la FUSM matriculados en el programa para el periodo 2016-2. Se determinó la prevalencia del síndrome por medio de los criterios de Roma III mediante una encuesta autodiligenciada. Se realizó un análisis univariado y bivariado en búsqueda de asociaciones.Resultados: se encontró una prevalencia de SII en 17,92% de 173 encuestados, el patrón mixto fue el más frecuente (77,41%). Hubo una posible asociación entre el SII y trastorno de ansiedad generalizada, presencia de al menos un síntoma gastrointestinal, y consumo de alcohol al menos una vez al mes.Conclusiones: la prevalencia del SII es del 17,92%, la ansiedad podría asociarse al SII. La depresión mayor no se relaciona con tener SII en este estudio. Se necesitan estudios que permitan ampliar la relación de los hábitos y estilos de vida incluidos el consumo de licor y cigarrillo.