Este artículo presenta los procesos de cambio como efectos de la implementación de las políticas públicas de evaluación y acreditación que de manera “voluntaria” son asumidos por las instituciones de educación superior colombianas. La investigación se abordó bajo la mirada del nuevo institucionalismo y mediante una investigación cualitativa, con un estudio de caso único en una institución de educación superior pública. Los resultados muestran los cambios a nivel de estrategia, estructura y cultura que operan desde lo institucional hacia lo organizacional que conduce a un isomorfismo institucional y competitivo y la dirige hacia un nuevo modelo de universidad que genera asimetrías en sus funciones misionales y cuestiona su identidad.