Magnolia pajarito una nueva especie de las vertientes de la Cordillera Oriental de los Andes de Colombia, es descrita, ilustrada y se discuten sus relaciones morfológicas con otras especies similares. Esta nueva especie es un árbol entre 9 y 30 m de altura, que se encuentra en remanentes de bosques montanos y con árboles dispersos (1500–1700 m) y aparentemente no esta cercanamente relacionada con ninguna especie en particular de Magnolia. M. pajarito comparte algunos caracteres con cuatro especies (M. arcabucoana, M. caricifragans, M. santanderiana y M. virolinensis) de la sección Talauma. Sin embargo, morfológicamente, tiene cierta similaridad con M. arcabucoana, de la cual difiere en el largo de la cicatriz adaxial del pecíolo, en el tamaño y forma de la hoja, sépalos y pétalos internos y en el número de las venas secundarias, hipsófilos vaginales y estambres. Adicionalmente, se incluye información del hábitat, un mapa de distribución, datos acerca del estado de conservación de Magnolia y una clave para la identificación de las especies de Magnolia presentes en Colombia. Esta nueva especie eleva actualmente en 40 el número de especies para la flora de Colombia, 31 son endémicas. Colombia es el país con la mayor diversidad del género en el neotropico.