En este trabajo de investigación se centrará en Determinar la incidencia de la auditoria tributaria como herramienta de control interno en las Pymes en Colombia. La elaboración de esta investigación se basó en fuentes primarias y secundarias para la obtención de información descriptiva usando así mismo técnicas de búsqueda como los operadores boléanos AND, OR. Se espera que con la realización de este informe investigativo se conozca cuáles son los componentes del Programa de auditoria tributaria para las pymes partiendo que se debe considerar la planeación de una auditoria como herramienta clave para que se obtengan los resultados esperados y así poder rendir un informe a las personas interesadas en conocer la situación real de una empresa en materia tributaria en el caso que se quiera se desee solicitar una devolución de saldo a favor o tener su información conforme a la normatividad, la determinación de la ejecución de una buena auditoria tributaria como una herramienta para el control interno de las Pymes en Colombia es de suma importancia puesto que está diseñada para brindar confiabilidad y brindar claridad sobre las técnicas para implementar en una auditoria y así poder identificar aquellas prácticas que pueden ocasionar la elaboración y preparación incorrecta de la información tributaria que termina con la procedencia de una sanción del ente fiscalizador. Por último, el análisis de los procedimientos de Auditoria tributaria interna de las pymes como herramienta preventiva, en donde se verifica la veracidad de la información a informa o previamente informada.