Introducción: la revisión de la variación en la mortalidad de una población permite identificar el posible impacto de una nueva enfermedad infecciosa, por lo que es deseable conocer con la mayor rapidez, las muertes que puedan estar atribuidas a un determinado agente infeccioso como es el SARS-CoV2. La revisión de varias fuentes de información permite comparar, detectar posibles subregistros y estimar una mortalidad aproximada a la realidad, para la toma de decisiones oportunas. En el mes de mayo de 2020 el INS brindó asistencia técnica en el Distrito Especial y Cultural de Cartagena con el objetivo establecer el subregistro de mortalidad por COVID-19, utilizando el método de captura – recaptura, con el fin de proporcionar información rápida sobre la introducción y avance de la pandemia. Metodología: estudio descriptivo, utilizando el método de captura recaptura para la estimación de las mortalidades por COVID-19. Las fuentes de información fueron los registros administrativos de RUAF y las licencias de inhumación. Resultados: se identificaron 254 defunciones por COVID-19, desde el 1 de marzo al 18 de mayo de 2020 en el registro de RUAF-ND y 203 defunciones en el registro de licencias de inhumaciones y cremaciones. Con la comparación de las dos fuentes se estimaron un total de 307 muertes para ese periodo. La estimación de la tasa de mortalidad utilizando el método de captura – recaptura fue de 29,3; con RUAF fue de 24,3 y con las licencias de defunción de 19,4. El porcentaje de subregistro fue de 17,2 % con relación a RUAF-ND. Conclusiones: el análisis conjunto de las fuentes de RUAF-ND y Licencias de inhumación y el uso de la metodología de captura-recaptura permitió tener una aproximación más real del comportamiento de las muertes por COVID-19 en el distrito de Cartagena en el momento de introducción del virus al territorio, lo que aportó a la caracterización oportuna de la magnitud del evento y el establecimiento de medidas de control específicas