El presente estudio tiene como objetivo describir las buenas prácticas relacionadas a factores organizacionales de la eficacia educativa en tiempos de pandemia en un Instituto de Educación Superior Privado del Perú. Estudio cualitativo, que, considera cuatro categorías de estudio para proceder a elaborar la guía de entrevista semiestructurada, la cual fue aplicada a líderes de la institución objeto de estudio. El estudio concluye que las buenas prácticas de liderazgo de la institución en el contexto de pandemia consisten en: i) desarrollar un estilo de dirección pedagógico; ii) acompañar al docente para garantizar resultados de aprendizaje y fortalecer la enseñanza; iii) fomentar un alto compromiso en los colaboradores gracias a la motivación, la cercanía y a la promoción de un liderazgo compartido; y finalmente, iv) desarrollar de herramientas ágiles que facilitan la comunicación y contribuye al logro de objetivos.