Las macromoléculas orgánicas son las principales componentes de la biomasa, entre ellas: carbohidratos, lignina y proteínas. La abundancia de enlaces tipo éter y éster en sus mesómeros los hacen susceptibles de ser despolimerizados y la aplicación de un ambiente hidrotérmico permite escoger la ruta predominante: hidrólisis o deshidratación, descarboxilación y escisión de grupos funcionales. En esta revisión se compilan esquemas de reacción hidrotérmicos, especialmente para polisacáridos y lignanos, los cuales son los principales contribuyentes a la diversidad química de los productos de conversión hidrotérmica de biomasa lignocelulósica y sus propiedades combustibles, debido a que la reducción en el contenido de oxígeno y el consecuente aumento del poder calorífico esta ligado a las reacciones de estas moléculas. La fracción hidrofóbica de los productos obtenidos por licuefacción y gasificación hidrotérmica parcial de los constituyentes de la biomasa puede utilizarse como bio-combustible.