En este trabajo, el mejoramiento de la resistencia a la polilla del tubérculo de la papa (PTP) en variedades cultivadas de papa utilizó como fuente de resistencia el germoplasma de Solanum sparsipilum. El análisis genético se hizo con una población híbrida dipliode F1 de 120 accesiones del cruce entre Solanum sparsipilum, diploide silvestre con resistencia observada a PTP, y Solanum phureja, diploide cultivado con susceptibilidad observada a PTP. A partir de las evaluaciones fenotípicas (antixenosis y antibiosis) en tubérculos de este cruce para la resistencia se obtuvieron tres grupos de descendientes: muy susceptible (HS), susceptible (S) y moderadamente resistente (MR). Se utilizaron cebadores tipo RAPD para identificar marcadores de ADN asociados a la resistencia del tubérculo a PTP. Se probaron 131 cebadores en la población F1. De éstos se usaron 77. La segregación de bandas observadas en la población F1 arrojó 58 marcadores RAPD para el alelo femenino. Diecinueve cebadores mostraron una desviación significativa de la esperada. Para el alelo masculino se localizaron 115 marcadores RAPD, 90 de los cuales no mostraron significativas distorsiones en la segregación. Un análisis de independencia entre la segregación de los marcadores RAPD y los grupos fenotípicos de resistencia mostró quince marcadores RAPD con una relación de desequilibrio hacia los grupos fenotípicos, lo que sugiere una asociación con la resistencia a PTP. A partir de los resultados obtenidos se ordenaron tres marcadores RAPD en el mapa genético de las cromátides hembras y doce marcadores RAPD en el mapa genético de las cromátides masculinas. De éstos, dos marcadores mostraron una asociación con resistencia a PTP a nivel de antixenosis y otros trece mostraron una asociación con resistencia a PTP a nivel de antibiosis.