Desde el nivel nacional se ha venido impulsado un proceso de regionalización en ciencia, Tecnología e Innovación (CTI), orientada a la elaboración de planes territoriales y definición de prioridades desde lo local, en este sentido Bogotá apoyado por Colciencias hizo en el 2010 un primer ejercicio con la participación de diferentes actores del Sistema y otros sectores. A pesar de estos avances, según el reporte de la agencia de noticias de la Universidad Nacional de septiembre del 2013, “la inversión para investigaciones sigue sin sobrepasar el 0,5% del PIB y las regalías para el sector de ciencia, tecnología e innovación no son suficientes. Para que el sistema funcione se necesitan recursos y políticas claras”. En este sentido es importante que se cuente con una Política en CTI para la salud, la cual debe considerar las prioridades de la investigación para la salud de Bogotá y proponer mecanismos de implementación, orientar la asignación de recursos y concertar los resultados esperados, de acuerdo con las necesidades actuales de la ciudad, y las necesidades planteadas por la sociedad, así como las propias de conocimiento del sector. Bogotá en consonancia con lo anterior en convenio con MALOKA, propuso el Plan de ciencia, tecnología e innovación para la salud, el cual ha permito avanzar en la consolidación de nuevos espacios y las alianzas con actores estratégicos del sistema, este articulo describe la estructura del Plan de Ciencia Tecnología e Innovación para la Salud en Bogotá.