Objetivo Evaluar comparativamente las iniciativas a escala nacional en contra de las zoonosis en países de América Latina mediante la adaptación de la evaluación prospectiva. Materiales y Métodos Se analizó la vigilancia de los eventos de interés en salud pública y medidas ejecutadas y se adaptó el método de evaluación prospectiva de Haegeman con cinco criterios: evaluación, pertinencia, eficacia, oportunidad y sostenibilidad; estos fueron especificados y aplicados de manera cualitativa para medir el logro y el efecto de cada una de las iniciativas, determinando la eficacia de manera objetiva y acortando el tiempo de comparabilidad. Resultados Los principales objetivos de los programas de zoonosis son reducir morbimortalidad, fortalecer la vigilancia epidemiológica y capacidad nacional. Los eventos vigilados se clasificaron en virales, bacterianos, parasitarios y acciones contra la mordedura por animal ponzoñoso y tenencia responsable de mascotas. Las medidas para controlar las zoonosis incluyen cinco actividades: promoción, prevención, diagnóstico, vigilancia y control. De los cinco criterios valorados, se infirió que las iniciativas siguen las recomendaciones de los reglamentos internacionales. Incluyeron colaboración intersectorial y corresponsabilidad social y fueron consecuentes con los objetivos planteados y sostenibles en el tiempo. Conclusiones La evaluación prospectiva evidenció que la pertinencia de los programas se ve reflejada en cómo los objetivos se enfocan en las necesidades de la sociedad frente a los riesgos de contagio de enfermedades zoonóticas. Las acciones implementadas de manera colaborativa apuntan a generar un impacto positivo con la sociedad y el ecosistema.