El estudio de los caracteres morfométricos permitió identificar las similitudes y diferencias poblacionales de abeja Melipona beecheii en el municipio de Cienfuegos. Para estudiar las afinidades morfométricas se seleccionaron de 10 obreras jóvenesdirectamente de la cámara de cría y se preservaron en etanol absoluto a -20°C para su posterior análisis morfométrico. Laevaluación de 12 caracteres morfológicos, 8 no presentaron diferencias significativas, excepto para el ancho de la cabeza(AC) 5,016 ± 0,014, largo de la cabeza (4,311 ± 0,024) y largo del fémur (4,398 ± 0,022) que fueron ligeramente mayores para muestras del meliponario ubicado en Pepe Rivas en comparación con las muestras de Reina, donde solo se mostró diferencia en el largo de la tibia (4,075 ± 0,028). El grado de maculación cefálica de las poblaciones de abejas estudiadas mostraron un grado de coloración en la media, rango en el cual las marcas amarillas cubren entre el 10 - 50% del clypeus y del área supraclypeal y se extienden como delgadas líneas en el área malar alrededor de los ojos. Los resultados sugierenque las poblaciones de abejas Melipona estudiadas en Cienfuegos son similares a las estudiadas en el occidente de Cuba y Yucatán.