Bacillus thuringiensis es el microorganismo entomopatógeno más ampliamente usado a nivel mundial como estrategia de control biológico de plagas. Así mismo es reconocido como un agente altamente cosmopolita, con capacidad de desarrollarse en una variedad de ecosistemas que van desde bosques lluviosos tropicales, hasta zohas de desierto. A pesar de la amplia distribución ecológica de la especie, la mayoría de estudios dirigidos hacia el aislamiento cepas de B. thuringiensis (Bt) han partido del análisis de muestras de suelo de ecosistemas agrícolas, donde se encuentran los insectos considerados como plaga que se desean controlar. En este estudio se comparó la diversidad y riqueza de Bt presente en muestras de suelo provenientes de bosques nativos del parque nacional natural (PNN) Katios y diferentes ecosistemas agrícolas (café, tabaco, pasto, papa y otros). Para lograr dicho objetivo se tomaron muestras de suelo para ser procesadas en el laboratorio por el método de Travers et al. (1987). De 28 muestras de suelo analizadas se obtuvieron 29 aislamientos, de los cuales 21 provienen del PNN Katios. El 83.3% de los aislamientos de bosque nativos presentaron patrones poco típicos para la especie en términos de sus cuerpos de inclusión y el perfil electroforético de las proteínas asociadas a éste. Por otra parte, de las muestras de ecosistemas agrícolas cabe destacar el aislamiento IBUN115A32 que mostró tres tipos diferentes de cristales y el aislamiento IBUN97B1 el cual presentó, en la reacción de PCR, indicios de poseer un nuevo gen cry. Los resultados obtenidos confirman la importancia de realizar estudios que involucren la búsqueda de nuevas cepas de Bt con el animo de conocer más ampliamente la diversidad de Bt y además, revindicar los bosques naturales como una fuente importante de muestras para este tipo de estudios.
