Las variaciones ontogenéticas en el cráneo ofrecen información del crecimiento y la ecología trófica en Crocodilia. Por lo tanto, analizamos las variaciones ontogenéticas de la forma y elementos óseos del cráneo en C. c. fuscus. Encontramos un efecto alométrico y cambios en la forma, ya que varía de un cráneo longirostrino en las crías a uno brevirostrino en subadultos y adultos. Se observó el ensanchamiento de la base del escamoso, del cuadratoyugal, del proceso lateral del pterigoides, del proceso retroarticular del articular y el desarrollo de una cresta dorsal en el surangular. Estos cambios, probablemente estarían relacionados con variaciones en la dieta durante la ontogenia, y tienen implicaciones ecológicas que deben ser consideradas en el estudio de la evolución y conservación de estas subespecies.